Die Ernte von Faserflachs ist eine ziemlich arbeitsintensive und verantwortungsvolle Aufgabe, von der nicht nur die Erhaltung der angebauten Ernte, sondern auch die Qualität des Flachsprodukts maßgeblich abhängt. Die Ernte und Primärverarbeitung von Flachs verursacht bis zu 75 % aller Kosten im Flachsanbau.
Beim Anbau von Faserlein in Nutzkulturen fallen Ballaststoffe und Samen gleichzeitig an, daher muss die Ernte zu einem Zeitpunkt erfolgen, an dem die größte Menge an Ballaststoffen mit der besten Qualität gesammelt werden kann und die Samen nach der Reifung zur Aussaat und Verarbeitung zu Öl geeignet sind. Dieser Zeitraum wird als technische Reife des Flachses bezeichnet.
Als optimaler Zeitpunkt für die Ernte von Faserflachs im Hinblick auf Faserqualität, physikalisch-mechanische Eigenschaften und Spinnfähigkeit gilt die frühe gelbe Reifephase. Die Reinigung erfolgt in kurzer Zeit – in 10... 12 Tagen. Für Saatkulturen ist der optimale Erntezeitpunkt die Gelbreifephase; die Samen werden in 5...6 Tagen geerntet.
Beginnt ein Betrieb mit der Ernte von Nutzpflanzen in der gelben Reifephase, die 5 bis 7 Tage dauert, besteht die Gefahr, dass ein Teil der Ernte in der Vollreifephase geerntet wird. Wenn der Faserlein voll ausgereift ist, wird die Faser spröde, vergröbert, es entsteht bei der Verarbeitung viel Abfall und die Stängel lassen sich schwerer altern.
Grüner Flachs, der in der Blütephase geerntet wird, zeichnet sich durch eine schlechte Basttrennung aus, erzeugt einen hohen Abfallanteil und der Faserertrag sinkt um 25 %. Zudem sind unreife (grüne) Samen meist nicht keimfähig.
Bei jeder Erntemethode ist es wichtig, den Reifegrad des Flachses an der Wurzel richtig zu bestimmen. Unter Produktionsbedingungen wird die Reifephase durch die Länge des von Blättern befreiten Stiels, durch die Farbe der Kisten und die darin enthaltenen Samen bestimmt.