بذور الكتان هي مصدر قيم لمجموعة متنوعة من المركبات النشطة بيولوجيا.
لديهم مجموعة واسعة جدا من الآثار الصحية. نتيجة تناولها، تقل احتمالية تكون جلطات الدم في القلب والرئتين والدماغ، ويقل ارتفاع ضغط الدم، كما تقل مخاطر الإصابة بالنوبات القلبية، والاحتشاءات الدقيقة، وعدم انتظام ضربات القلب، والأمراض المرتبطة بصمامات القلب، واضطرابات القلب التاجية. ويتم تقليل أمراض القلب والأوعية الدموية الأخرى.
نظرا للمحتوى العالي من الأحماض الدهنية المتعددة غير المشبعة (أوميغا 3، أوميغا 6) في بذور الكتان، فإن مناعة الجسم الشاملة تزيد وتقوي.